Kommuner kan få tillbaka moms på kostnader som tillhör den del av verksamheten som inte omfattas av betalningsskyldighet och avdraget görs då i systemet för momsersättning till kommuner. Den ersättning kommuner erhåller för bidrag till näringsidkare inom sjukvård, tandvård, social omsorg och utbildning samt för upphandling inom nämnda områden beräknas schablonmässigt. Enligt ett alternativ erhålls ersättning med 6 % av den kostnad som ger rätt till ersättning.